Linuxで任意のウィンドウを透過する方法

Linuxで任意のウィンドウを最前面，最小化するプログラムの続きです．
これでEmacsを瞬時にブラウザの上に被せることができますが，Emacsが透過していないとブラウザを見ながらの入力ができません．
僕はEmacsを重ねたくて行なっていますが，Emacs以外でも可能です．
Compizを使用しています．

CCSMが必要なので，インストールしていない場合はインストールが必要です．

% sudo apt-get install compizconfig-settings-manager

CompizConfig設定マネージャを起動します．

不透明度・明度・彩度を選択します．

透過したいアプリを選択し，透明度を選択します．

以上です．

これで僕はEmacsを瞬時にブラウザなどの上に被せてメモを書くことができるようになりました．